Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAMP1P23763 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms