Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4BPBP20851 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4BPBP20851 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms