Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPN2P17655 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms