Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBBP9O75884 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms