Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NIPSNAP2O75323 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms