Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC22O60826 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms