Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP104O60308 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP104O60308 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP104O60308 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP104O60308 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP104O60308 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEP104O60308 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEP104O60308 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms