Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDE6DO43924 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PDE6DO43924 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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