Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CENPBD1B2RD01 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms