Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB19A4D1S5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms