Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX11L9-202ENST00000560040 573 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140658.1-201ENST00000563019 346 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4283-2-201ENST00000578980 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4283-1-201ENST00000582960 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 APOC1-201ENST00000586638 425 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FXYD1-206ENST00000588715 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00649-209ENST00000597626 612 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016885.3-201ENST00000598428 258 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6777-201ENST00000613934 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6744-201ENST00000619480 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT17-205ENST00000618959 3012 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH8-203ENST00000400441 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136944.2-201ENST00000568752 3971 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005324.4-204ENST00000413242 4262 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK2-201ENST00000256935 6097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD14-201ENST00000344227 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SUFU-203ENST00000423559 2601 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK1-201ENST00000377084 5189 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM59-201ENST00000309784 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX2-208ENST00000584379 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CHRM3-207ENST00000615928 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK4-211ENST00000515069 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSS1-205ENST00000537502 3509 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH13-203ENST00000621918 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF154-202ENST00000512439 5687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ACKR1-204ENST00000537147 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EFL1-202ENST00000359445 3470 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms