Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
U3KQE9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
U3KQE9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
U3KQE9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms