Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDD3Q9Y3P4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms