Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAF8Q9UPN6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAF8Q9UPN6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms