Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF275Q9NSD4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms