Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLE3Q9NRF9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms