Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM55Q9BYV6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms