Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHD1Q9BUP0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHD1Q9BUP0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms