Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOXF2Q9BQY4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOXF2Q9BQY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms