Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TSNARE1Q96NA8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms