Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMTM3Q96MX0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms