Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNBD2Q96M20 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNBD2Q96M20 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms