Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RNF185Q96GF1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RNF185Q96GF1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms