Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms