Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCC1Q96CN9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms