Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TTLL11Q8NHH1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL11Q8NHH1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms