Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGSF1Q8N6C5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGSF1Q8N6C5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms