Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD40Q6AI12 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms