Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SBK1Q52WX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms