Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKIDA1Q1XH10 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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