Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEBPEQ15744 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CEBPEQ15744 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CEBPEQ15744 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CEBPEQ15744 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms