Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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