Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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