Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECTIN1Q15223 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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