Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA3AQ14563 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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SEMA3AQ14563 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3AQ14563 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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