Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBX3Q13185 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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