Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRKAA1Q13131 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRKAA1Q13131 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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