Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNIP1Q12981 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms