Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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