Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms