Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO4P61968 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms