Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VBP1P61758 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VBP1P61758 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VBP1P61758 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms