Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2NP61088 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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