Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2MP61081 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms