Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RBP2P50120 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RBP2P50120 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBP2P50120 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms