Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms