Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTDSS1P48651 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTDSS1P48651 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms