Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN2P35609 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN2P35609 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms