Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA4P34932 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms