Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRKCHP24723 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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